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有了DNA存儲(chǔ)技術(shù),我們?nèi)梭w就是云硬盤

   日期:2017-04-12     瀏覽:190    
核心提示:發(fā)布日期:2017-04-12 我們?nèi)梭w的所有信息都由DNA編碼組成。你可曾想過(guò),DNA能夠

發(fā)布日期:2017-04-12

我們?nèi)梭w的所有信息都由DNA編碼組成。你可曾想過(guò),DNA能夠像U盤一樣存儲(chǔ)信息?美國(guó)《科學(xué)》雜志近日發(fā)布的一項(xiàng)研究顯示,一克DNA的儲(chǔ)存容量相當(dāng)于約20萬(wàn)臺(tái)電腦!具體容量約為200 PB(20萬(wàn)兆)。這是因?yàn)镈NA具有密度大、穩(wěn)固耐用的特點(diǎn)。專家指出,當(dāng)今時(shí)代信息爆炸,只要解決了成本問(wèn)題,那么DNA儲(chǔ)存技術(shù)的市場(chǎng)空間將無(wú)可限量。

DNA存儲(chǔ)技術(shù):并非首創(chuàng)

其實(shí)DNA儲(chǔ)存技術(shù)早已有人在做了。2012年,哈佛大學(xué)研究人員用DNA儲(chǔ)存了一本五萬(wàn)字的圖書(shū)。歐洲生物信息研究所(European Bioinformatics Institute )也在DNA儲(chǔ)存了莎士比亞的十四行詩(shī)以及馬丁·路德·金的演講《我有一個(gè)夢(mèng)想》的錄音帶。

突破性進(jìn)展:存儲(chǔ)效率大幅提升

盡管不是首創(chuàng),但是,這項(xiàng)DNA存儲(chǔ)技術(shù)目前迎來(lái)了重大突破。研究員Erlich是該研究報(bào)告的作者之一,他表示:這是因?yàn)檫\(yùn)用了一種編碼技術(shù),能讓DNA存儲(chǔ)效率提升60%,還能有效減小DNA存儲(chǔ)過(guò)程中的出錯(cuò)率。他在美國(guó)哥倫比亞大學(xué)擔(dān)任計(jì)算機(jī)科學(xué)系教授,同時(shí)也是紐約基因組中心(New York Genome Center)的核心成員。

“把數(shù)據(jù)輸入DNA只需要不到一秒鐘。DNA說(shuō)白了只不過(guò)是四種核苷酸(nucleotides)排列組合的結(jié)果。我們只需要把這些核苷酸和數(shù)據(jù)一一對(duì)應(yīng)。”

研究員Erlich說(shuō),一旦掌握了編碼方法,或者找到了符合編排或數(shù)據(jù)輸入要求的DNA,那接下來(lái)的工作就很輕松了。這是因?yàn)椋梢杂善髽I(yè)來(lái)負(fù)責(zé)DNA的實(shí)際制造過(guò)程。

獨(dú)特魅力

“這么做,是為了激發(fā)人們的想象力嗎?沒(méi)錯(cuò)!就是想讓人們感受到科學(xué)有趣的一面!”

DNA具有密度大、穩(wěn)定性高的優(yōu)勢(shì),因此DNA儲(chǔ)存技術(shù)仍然比新興的同類技術(shù)更讓科學(xué)家著迷。研究員Kosuri說(shuō):“DNA儲(chǔ)存技術(shù)所涉及的難度,相當(dāng)于把單個(gè)原子放在一個(gè)物體表面。” 他指的是IBM公司,該公司曾在1989成功用35個(gè)氙原子拼出了“IBM”的字樣。

他說(shuō):“排列原子也不是不可能的事,但必須要運(yùn)用極高的成像技術(shù),在接近于絕對(duì)零度的真空狀態(tài)下才能完成。這就涉及到核心技術(shù)了。相比之下,我們的DNA技術(shù)要比它更實(shí)用,雖然在存儲(chǔ)方面肯定沒(méi)有軟盤或U盤那么實(shí)用。”

DNA還可以儲(chǔ)存3D影像。雖然全息存儲(chǔ)(holography memory)和賽道儲(chǔ)存(racetrack memory )技術(shù)也可以做到,但是研究員Kosuri說(shuō),DNA技術(shù)能儲(chǔ)存的密度比它們要高得多。

克服技術(shù)難點(diǎn)

但是,DNA的合成過(guò)程是非常艱辛的。研究員Kosuri表示:“難就難在,DNA合成過(guò)程中,約有5%的時(shí)間,會(huì)損失掉隨機(jī)合成的一個(gè)DNA。而且,不僅合成困難,就連讀取DNA也是一個(gè)問(wèn)題。如果有一種編碼技術(shù)能夠避免這種損失,那么DNA存儲(chǔ)技術(shù)就會(huì)變得簡(jiǎn)單得多,也利索得多。”

美國(guó)《科學(xué)》雜志發(fā)布的這項(xiàng)研究,的確實(shí)現(xiàn)了這種編碼技術(shù)。研究員Kosuri表示,這項(xiàng)技術(shù)可以讓DNA合成過(guò)程中出現(xiàn)的失誤容易讓人接受。這要?dú)w功于一種特殊的編碼技術(shù),而用這項(xiàng)技術(shù)傳送數(shù)字信息,通常能夠適應(yīng)連接中斷的情況發(fā)生,比如在智能手機(jī)上播放Youtube視頻。Erlich表示,這就意味著,這種編碼技術(shù)能夠處理那些比研究中使用的DNA質(zhì)量低得多的DNA。

研究員Kosuri沒(méi)有參與該項(xiàng)研究,但他是上述2012年哈佛大學(xué)研究報(bào)告的第一作者,如今是加利福尼亞大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)的一名生物化學(xué)教授。

蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院化學(xué)工程師Grass也參與了這項(xiàng)研究,他表示,研究團(tuán)隊(duì)成功地在DNA中存儲(chǔ)并且恢復(fù)了一個(gè)操作系統(tǒng),是個(gè)“優(yōu)雅的成就”。他還說(shuō):“我每天都在‘使用’DNA,所以我明白這項(xiàng)工程必須要萬(wàn)無(wú)一失。” Erlich表示,他們是故意把那個(gè)操作系統(tǒng)放進(jìn)DNA的。”如果不把文件完美地恢復(fù),那么就可能會(huì)損毀某些內(nèi)容。但我們就是要證明我們不怕把這種可能會(huì)損毀的內(nèi)容放進(jìn)DNA。”

Kosuri也同意這種方法十分高效:“我認(rèn)為他們采用了正確的實(shí)驗(yàn)測(cè)試算法。他們選對(duì)了算法,而且看起來(lái)很奏效。”

成本巨大

在化學(xué)工程師Grass看來(lái),合成DNA的成本比編排DNA的成本還要大。他說(shuō):“雖然編排DNA的成本太高,無(wú)法實(shí)際應(yīng)用,不過(guò)現(xiàn)在有了納米微孔 (nanopore) 插入計(jì)算機(jī)進(jìn)行DNA編排的技術(shù),所以它的成本越來(lái)越小了。但是,合成DNA的成本仍然十分之高。”

研究員Kosuri也表示:“DNA儲(chǔ)存技術(shù)規(guī)?;瘧?yīng)用的唯一阻礙就是,它的成本實(shí)在是太高了。關(guān)于編碼、編碼的工作方式以及這種編碼是否可靠等種種問(wèn)題,我們的研究報(bào)告都一一解答了。但是,唯獨(dú)成本問(wèn)題,是我們目前解決不了的。”

Grass認(rèn)為,要想讓DNA能夠儲(chǔ)存信息長(zhǎng)達(dá)數(shù)百年之久,就必須要采用另外一些手段把DNA固定住。他解釋道,基因物質(zhì)可以在動(dòng)物骨頭和動(dòng)植物化石中固定保存,但是自由DNA卻不一樣,具有不穩(wěn)定性。如果把它放在實(shí)驗(yàn)室,一年以后里面的信息就會(huì)開(kāi)始損毀了。

前景:依然明朗

研究員Kosuri已經(jīng)不再?gòu)氖翫NA儲(chǔ)存技術(shù)研究,但是他本人對(duì)這項(xiàng)技術(shù)的發(fā)展還是持樂(lè)觀態(tài)度。他說(shuō):“上百萬(wàn)倍的成本聽(tīng)起來(lái)很嚇人,但是在過(guò)去的15年,我們已經(jīng)把成本縮小為原來(lái)的上百萬(wàn)分之一了?,F(xiàn)在,不僅僅是編排DNA,就連合成DNA的成本也已經(jīng)有所下降。”

研究員Erlich憧憬在未來(lái),有人可以發(fā)明一種“專門用于DNA存儲(chǔ)的工序,方便我們快速合成劣質(zhì)DNA”,從而減少成本。他說(shuō):“我們可以質(zhì)量參差不齊的DNA先提取出來(lái),然后再根據(jù)編碼方式來(lái)逐步對(duì)其進(jìn)行糾正。這是我們未來(lái)的研究方向”

目前的研究是一個(gè)良好的開(kāi)端。研究員已經(jīng)在DNA存儲(chǔ)了許多內(nèi)容,它們能靈敏地減少存儲(chǔ)錯(cuò)誤,其中包括:一個(gè)操作系統(tǒng)、一個(gè)電腦病毒、一張價(jià)值50美元的亞馬遜禮品購(gòu)物卡、1895年于法國(guó)上映的世界上第一部電影《火車到站》(Arrival of a train at La Ciotat)、航天飛行器“先驅(qū)者”(Pionner)的一塊載有人類訊息的鍍金鋁板以及美國(guó)數(shù)學(xué)家、信息論的創(chuàng)始人克勞德·艾爾伍德·香農(nóng)(Claude Elwood Shannon)于1948年發(fā)表的一篇研究報(bào)告。

研究員Erlich說(shuō):“有人問(wèn)我,‘你怎么能夠把視頻存進(jìn)DNA呢?’ 這也是我要向我6歲小兒子解釋的問(wèn)題。”

來(lái)源:36Kr

 
 
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